За първи път футбол се играе в Неврокоп през октомври 1912 г. малко след освобождаването на града от османска власт, когато военни от местния гарнизон показват пред хората от играта с футболната топка, която завладява целия свят. Жителите на Неврокоп примат ентусиазирано новата игра и не след дълго се създава футболна секция към гимнастическо дружество „Юнак“. През 1925 г. се отделя и приема името „Пирин“, който е първият отбор с името на българската планина, в чиито поли се намира Гоце Делчев.
Футболът след Войната
След 1949 година съществуват 14 градски отбора, създадени на ведомствен принцип – „Строител“, „Червено знаме“ (1949 – 1959), „Динамо“, „Спартак“, „Пирин“ и други, които се развиват към съответните отраслови профсъюзи.
През 1957 година всички тези отбори, без „Спартак“, са обединени в Дпужество за физическа култура и спорт „Пирин“.
Първо влизане в „Б“ група
За първи път „Пирин“ се класира в „Б“ група през 1982 година, където играе до 1985 г., когато отборът е изваден по административен път с неясни аргументи от „Б“ група, след като е заел седмо място.
Отборът се завръща във втория ешелон през 1993 г. и играе там до пролетта на 1995 г.
За трети път „Пирин“ (Гоце Делчев) влиза в „Б“ група през есента на 2005 година През сезон 2006/2007 се класира на трето място във втория ни ешелон.
Историческо влизане в „А“ група
Сезон 2011/2012 се оказва най-силния в историята на Пирин (Гоце Делчев). Отборът печели Западната „Б“ група (тогава „Б“ групите са разделени на две – Западна и Източна). Пирин финишира на първо място с 62 точки, на 6 пред втория Спортист (Своге).
Така Пирин (Гоце Делчев) след 27 мача, в които има 19 победи, 5 равни и 3 поражения, получава правото да играе в елита на българския футбол!
Официализиране на влизането бе в предпоследния 26 кръг от сезон 2011/2012, когато Пирин (Гоце Делчев) постигна минимална победа с 1:0 при гостуването си на Академик (София), а в същото време преследвачът Спортист (Своге) претърпя домакинска загуба с 0:1 от Сливнишки герой. Треньор на отбора е Яков Папарков.
Основна заслуга за историческия момент имат: Виктор Шишков, Георги Самокишев, Николай Димитров, Абди Абдиков, Румен Лапантов, Георги Каранейчев, Веселин Здравков, Любомир Гуцев, Никола Николов, Димитър Пиргов, Атанас Фиданин, Григор Георгиев, Зефир Катунчев, Ангел Юсев, Радослав Моллов, Борис Шиндов, Илия Карапетров, Антон Киров, Иван Площаков, Димитър Коршумов, Свилен Щерев, Георги Петров.
Футболистите на Пирин заявиха, че посвещават успеха на тима на верните си фенове, които им оказват безрезервна подкрепа на всички мачове.
Празнично украсеният стадион бе опасан с транспаранти, посветени на елитния футболист Мартин Газиев. Газиев стана играч на 2011 във втородивизионния” Пирин “Гоце Делчев, след което премина в македонския “Работнички”.
Макар той да не бе на терена сред празнуващите, бе награден с медал, който бе връчен на баща му.
С медали освен футболистите бяха удостоени и треньорите. Всички от трибуните станаха на крака и бурно поздравиха кмета на Гоце Делчев Владимир Москов, който също получи медал за подкрепата към клуба.
Два поредни сезона в „А“ група
В първия си сезон в елита 2012/2013 отборът от Гоце Делчев запазва елитния си статут и завършва на 11 място от 16 тима (дори изпадат четири отбора в крайното класиране).
Първият исторически мач на Пирин в „А“ група е на 12 август срещу Миньор (Перник). Домакините печелят с 2:1 след голове на Борислав Стойчев и Любомир Гуцев.
На стадиона в Гоце Делчев има над 4500 зрители, които бурно аплодират победата на любимците си.
Състав на Пирин (ГД) от първия мач в „А“ група: 83.Абди Абдиков, 18.Румен Лапантов, 5.Любомир Гуцев, 3.Димитър Пиргов, 6.Атанас Фиданин, 8.Петър Лазаров (капитан), 21.Васил Панайотов, 10.Веселин Марчев, 7.Албин Одза, 20.Драги Коцев, 9.Борислав Хазуров
Резерви: 88.Ангел Юсев, 4.Атанас Дреновички, 30.Иван Стоянов, 6.Свилен Щерев, 17.Никола Николов, 11.Виктор Шишков, 19.Григор Георгиев
Старши треньор: Яков Папарков
През сезона Пирин (Гоце Делчев) прави равенство у дома срещу Левски (1:1). Мачът е през пролетта на 2013 година, а попадението за домакините реализира Любомир Витанов в 82-ата минута. Треньор на Пирин (Гоце Делчев) вече е Тенчо Тенев.
„Неврокопчани“ побеждават Локомотив Пловдив, Черно море, Локомотив София, Ботев Враца, Миньор Перник и Монтана на свой терен.
А като гост?! Пирин (Гоце Делчев) прави равен с шампиона Лудогорец, печели като гост над Берое в Стара Загора с 3:2, както и срещу Локомотив София с 1:0 в столицата.
Втори сезон в „А“ група
За разлика от първия дебютен сезон в елита, през втория (сезон 2013/2014) Пирин (Гоце Делчев) не успява да задържи елитния си статут и изпада в края на шампионата.
Първенството е разделено на две етапа, като в първия етап отборите играят по два пъти на разменено гостуване общо 26 мача. След първия етап Пирин (Гоце Делчев) е предпоследен (13 място) с 15 точки след 4 победи, 3 равенства и 19 загуби, голова разлика 23:71.
Във втория етап отборът печели само още 7 точки и след 38 изиграни двубоя, „неврокопчани“ имат 6 победи, 4 равенства и 28 загуби, голова разлика 35:91, с което изпада. Единствен под него в крайното класиране е Любимец с 21 точки.
Отказ на лиценз за „Б“ група
През лятото на 2014 година изпадналият вече Пирин (Гоце Делчев) не получава лиценз и за участие в „Б“ група. Така отборът отива директно в Югозападната „В“ група.
През сезон 2014/2015 „неврокопчани“ правят опит веднага да се върнат в професионалния футбол, но завършват на 3 място в Югозападната „В“ група с 62 точки, на 8 от победителя Оборище (Панагюрище).
Следва 15 място в Югозападната Трета лига през сезон 2015/2016, 10 място през сезон 2016/2017.
Изпадане до областните групи
През сезон 2017/2018 се стига до изпадане в областните групи след 17 място.
Така за първи път от много години през 2018/2019 отборът дори не е в Трета лига.
След два сезона в четвърта дивизия, все пак неврокопчани се завръщат в Трета лига за сезон 2020/2021 и завършват на 9 място. Следва 8 място през 2021/2022 и ново изпадане след 21-о място в крайното класиране на шампионат 2022/2023.
След един сезон в четвърта лига отборът все пак бързо се завръща в Югозападната Трета лига за старта на сезон 2024/2025.
Известни футболисти
- Атанас Петков
- Георги Леваков
- Стоян Карапетров
- Димчо Беляков
- Ясен Петров
- Йордан Боздански
- Методи Стойнев
- Иван Близнаков
- Росен Каптиев
- Марио Метушев
- Методи Методиев
- Георги Василев (Гочо)
- Марио Близнаков
- Димитър Макриев
- Илиан Харизанов
- Васил Мингов
- Симеон Гавалюгов
- Георги Марков
- Георги Петров
- Димитър Пиргов
- Васил Панайотов
- Костадин Башов
- Димитър Вълчев
Класиране в последните сезони
| 2023/2024 | „А“ Областна група Благоевград | 1 място |
| 2022/2023 | Югозападна Трета лига | 21 място |
| 2021/2022 | Югозападна Трета лига | 8 място |
| 2020/2021 | Югозападна Трета лига | 9 място |
| 2019/2020 | „А“ Областна група Благоевград | 1 място |
| 2018/2019 | „А“ Областна група Благоевград | 2 място |
| 2017/2018 | Югозападна Трета лига | 17 място |
| 2016/2017 | Югозападна Трета лига | 10 място |
| 2015/2016 | Югозападна Трета лига | 15 място |
| 2014/2015 | Югозападна Трета лига | 3 място |
| 2013/2014 | „А“ група | 13 място |
| 2012/2013 | „А“ група | 11 място |